Usa-Places.com listou aprox 24 igrejas dentro Muskogee. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro Muskogee estão- Nova Igreja Comunitária, A igreja de tijolos, Centro Cristão Powerhouse de Deus, Capela Cristã, Igreja da Restauração Muskogee, Igreja dos Construtores do Reino de Cristo, Harvest Ministries Church Inc, Fé Libertação Cristã, Igreja Comunitária Eastside & Igreja New Life Center.