Usa-Places.com listou aprox 24 igrejas dentro Muskogee. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro Muskogee estão- Igreja Buckhorn, A ponte na Igreja de Cristo, York Street Christian Church, Igreja da Família Thrive, Tabernáculo Grandview, Grace Bible Church, Igreja de Deus de East Shawnee, Igreja Central, Igreja Farol de Muskogee & Igreja doméstica Muskogee - Igreja doméstica Muskogee.