Usa-Places.com listou aprox 9 igrejas dentro São Rafael. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro São Rafael estão- Sociedade Espírita Chico Xavier, Primeira Igreja Congregacional, Mosteiro Carmelita da Mãe de Deus, Igreja da Comunidade Asiática de Marin, Igreja de Hillside de Marin, Centro Cristiano International, Priscilla Tedesco Christian, Centro Cristiano International & Igreja na encosta do Vale de Marin Lucas.