Usa-Places.com listou aprox 8 igrejas dentro São Francisco. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro São Francisco estão- Assembleia da Igreja de São Francisco, Iglesia Evangelica Bethesda, San Francisco Christian Center, Igreja Daring Faith Celebration Center, Primeira Igreja Cristã Congregacional Samoana, Igreja de Deus Ministério de Jesus Cristo Intl. – Iglesia de Dios Ministerial -IDMJI -CGMJI CA S. Franc, Mission Bay Community Church & San Francisco Community Fellowship.