Usa-Places.com listou aprox 23 igrejas dentro Muskegon. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro Muskegon estão- Jericho Road Church, Palavra viva, Igreja do Ponto de Conexão, Igreja Apostólica de Deus-Muskegon, Bethany Christian Reformed, New Life Christian Center, Ministérios da Comunidade Applewood, Igreja Evangélica Livre das Oliveiras - Campus Marquette, Faith Bible Church & Igreja Cristã da Allen Avenue.