Usa-Places.com listou aprox 10 igrejas dentro Muskegon. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro Muskegon estão- Igreja da Aliança da Embaixada do Reino, Primeira Igreja Congregacional, Igreja da comunidade de celebração, Igreja de Port City - Campus McGraft, Igreja Luterana Harbour of Grace ELCA, Igreja Reformada Westwood, The Way Church, Igreja da Comunidade Shoreline, Igreja Farol Full Life Center & Shore Line Christ Fellowship.