Usa-Places.com listou aprox 13 igrejas dentro Juneau. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro Juneau estão- Igreja Bíblica de Auke Bay, Juneau Christian Center, Igreja de Deus do Vale Glaciar, Igreja Desperta, Douglas Island Bible Church, Diocese de Juneau, Eckankar, Eckankar, Igreja Radiante & Centro Juneau Shambhala.