Usa-Places.com listou aprox 9 igrejas dentro El Cajon. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro El Cajon estão- Rock Church East County, Contabilidade da Unidade da Igreja de Cristo, Igreja Kaleo, Igreja Hope City, Igreja de Narrativas, Igreja Nova Vida, Igreja Cristã Maranata, Igreja de Louvor & Igreja sem limites de San Diego.