Usa-Places.com listou aprox 8 igrejas dentro São Francisco. Alguns dos mais bem avaliados igrejas dentro São Francisco estão- Igreja do marinheiro norueguês, Igreja da Comunidade Metropolitana de São Francisco, Igreja Espiritualista Golden Gate, Faith Christian Center, Svenska kyrkan, Igreja para a comunhão, Igreja Católica Japonesa São Francisco Xavier & Sala de Leitura da Ciência Cristã.